A utilização de biotecnologia para valorização de biomassa, a exploração de recursos genéticos dos Açores para extracção de novas moléculas bioativas, são domínios de interesse onde tem desenvolvido investigação. Neste contexto, esteve envolvido em vários projectos de investigação. É co-autor em 24 publicações científicas internacionais, várias delas resultantes de trabalho conjunto com investigadores europeus e americanos. Tem 432 citações científicas. Publicou 4 capítulos em livros com ISBN e tem o registo de 29 sequências de novos genes, 3 transcriptomas e 3 genomas bacterianos no NCBI. Tem 15 comunicações orais em congressos científicos internacionais e 7 em congressos nacionais. Recebeu convites como orador e como moderador para várias reuniões científicas. Tem investido no seu enriquecimento na aplicação de técnicas modernas para aplicação em Biotecnologia. Participa na comissão científica da Rede Portuguesa de Vesículas Extracelulares (PNEV), coordena a participação do CBA na Infraestrutura Nacional para a Química Biológica e Genética (PT-OPENSCREEN).

Além da experiência em investigação, na leccionação e na orientaçãode pós-graduações, tem produzido conteúdos pedagógicos, em livro e em formato digital, e organizado várias ações de formação. É coordenador científico do Observatório Microbiano dos Açores e tem participado em várias ações de divulgação científica, de extensão à sociedade e promoção de literacia científica em contextos formais e não formais.